Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B619

Trav14d-3-dv8, MCG142750 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trav14d-3-dv8A0A075B619 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms