Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trbv4A0A075B5I2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trbv4A0A075B5I2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trbv4A0A075B5I2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trbv4A0A075B5I2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trbv4A0A075B5I2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trbv4A0A075B5I2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trbv4A0A075B5I2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trbv4A0A075B5I2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trbv4A0A075B5I2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trbv4A0A075B5I2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trbv4A0A075B5I2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trbv4A0A075B5I2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trbv4A0A075B5I2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trbv4A0A075B5I2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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