Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cited4Q9WUL8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms