Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trpv2Q9WTR1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trpv2Q9WTR1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms