Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tspan11Q9D1D1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tspan11Q9D1D1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms