Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gtpbp4Q99ME9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms