Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gps1Q99LD4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms