Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lmod2Q3UHZ5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms