Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MitfQ08874 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms