Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cmklr1P97468 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms