Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl9P51670 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl9P51670 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms