Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox2P48432 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sox2P48432 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms