Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TfamP40630 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TfamP40630 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TfamP40630 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TfamP40630 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TfamP40630 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TfamP40630 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TfamP40630 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TfamP40630 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TfamP40630 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TfamP40630 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TfamP40630 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TfamP40630 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TfamP40630 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TfamP40630 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms