Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxa10P31310 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms