Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoP15409 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoP15409 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoP15409 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoP15409 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoP15409 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoP15409 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RhoP15409 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RhoP15409 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RhoP15409 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RhoP15409 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RhoP15409 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RhoP15409 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RhoP15409 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms