Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
BsnO88737 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BsnO88737 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BsnO88737 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BsnO88737 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
BsnO88737 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BsnO88737 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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