Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klc1O88447 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klc1O88447 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms