Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chil3O35744 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms