Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bbip1J3QMK2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms