Protein–RNA interactions for Protein: G3UVW3

Slc38a6, Probable sodium-coupled neutral amino acid transporter 6, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a6G3UVW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a6G3UVW3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc38a6G3UVW3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms