Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt2E9PUL5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prrt2E9PUL5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrt2E9PUL5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms