Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf1B2RRD7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf1B2RRD7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms