Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn19Q9ET38 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Cldn19Q9ET38 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms