Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ms4a4bQ9ES61 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms