Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1ip1Q9CQ20 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms