Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gps1Q99LD4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gps1Q99LD4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms