Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx15Q91WE1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx15Q91WE1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms