Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcl3Q8BVF2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcl3Q8BVF2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms