Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cnot1Q6ZQ08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cnot1Q6ZQ08 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms