Protein–RNA interactions for Protein: Q60865

Caprin1, Caprin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin1Q60865 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Caprin1Q60865 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Caprin1Q60865 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125 ms