Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctf1Q60753 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctf1Q60753 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms