Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arcn1Q5XJY5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arcn1Q5XJY5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms