Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
WhammQ571B6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
WhammQ571B6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
WhammQ571B6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms