Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sdr16c6Q05A13 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdr16c6Q05A13 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdr16c6Q05A13 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdr16c6Q05A13 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdr16c6Q05A13 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdr16c6Q05A13 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdr16c6Q05A13 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sdr16c6Q05A13 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms