Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pfdn6Q03958 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pfdn6Q03958 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms