Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cmklr1P97468 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms