Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmod1P49813 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmod1P49813 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms