Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb41P48193 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb41P48193 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Epb41P48193 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epb41P48193 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epb41P48193 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epb41P48193 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms