Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rom1P32958 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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