Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnga1P29974 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnga1P29974 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms