Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RhoP15409 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RhoP15409 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RhoP15409 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RhoP15409 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RhoP15409 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RhoP15409 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RhoP15409 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RhoP15409 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RhoP15409 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RhoP15409 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RhoP15409 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms