Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxb3P09026 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxb3P09026 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms