Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vamp4O70480 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms