Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dkk1O54908 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dkk1O54908 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms