Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpd52l1O54818 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpd52l1O54818 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms