Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chil3O35744 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chil3O35744 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chil3O35744 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chil3O35744 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms