Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacna1iE9Q7P2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms