Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pm20d2A3KG59 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pm20d2A3KG59 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms