Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AatfQ9JKX4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
AatfQ9JKX4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AatfQ9JKX4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms