Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3glb1Q9JK48 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3glb1Q9JK48 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms